Hola, hay diferentes posibilidades.
En mi opinión, lo ideal es poner la sonda del termostato fuera del cajón, para que la lectura que realice no se vea afectada por ningún elemento interno, orina, heces, agua, la propia bicha...yo estoy en hacer un rack pequeñito de 2 o 3 cajones, y lo pondré fuera bajo el tupper y entre dos de las líneas del cable térmico.
Una vez puesto a andar, calibras, es decir, haces pruebas con el termómetro para ver a cuánto has de limitar el termostato, para que dentro tenga la temperatura ideal.
Yo por ejemplo tengo la sonda entre las tiras de cable y le marco al termostato casi 33ºC que se traducen en 31,5ºC aprox en el interior.
Si pones en youtube "how to heat a snake rack" o ")IY snake rack", verás muchos tutoriales dónde cada uno a su manera explica cómo coloca la sonda del termostato.